В 1С:Предприятие 8 есть богатые возможности для отборов и настроек списков. В журнале счетов войдите в пункт меню Действия - Установить отбор и сортировку списка. На закладке отбор установите Организация, равно, Наша организация 1. Затем нажмите кнопку Отборы - Сохранить. Аналогично проделайте с организацией Наша организация 2. Теперь у нас сохранилась история отборов: По кнопке Действие в списке открываем пункт меню История отборов и выбираем желаемый отбор. Аналогично можно сделать в журнале документов реализации и счетов-фактур.